Normaaleissa olosuhteissa kohdunkaulan eritteillä ja emättimen transudaatilla on vaalea väri, joka pyrkii läpinäkymään ja miellyttävä haju. Monet naiset eivät kuitenkaan ole samaa mieltä ja - vaikka tämä aromi on aivan normaalia - pitävät sitä liian läpäisevänä; tätä varten he pyrkivät peittämään sen soveltamalla erilaisia kosmetiikkatyyppejä tai suorittamalla emättimen puhdistusta.
Erityisissä olosuhteissa emättimen haju voi tulla erityisen raskaaksi ja epämiellyttäväksi siihen pisteeseen, että sitä kuvaillaan klassisen ilmaisun "haiseva kala" avulla. Tämä on selvä osoitus siitä, että jotakin intiimillä tasolla ei toimi kunnolla. Useimmissa tapauksissa huono haju johtuu sellaisten patogeenien ylikasvusta, joita tavallisesti esiintyy emättimessä niin pieninä määrinä, että ne ovat vaarattomia. Tätä tilannetta kutsutaan bakteeri-vaginosikseksi. Vaikka korkea seksuaalinen suvaitsemattomuus on tärkeä riskitekijä, emättimen syitä löytyy myös liiallisesta tai riittämättömästä intiimihygieniasta, kohdunsisäisten mekaanisten ehkäisyvälineiden käytöstä ja jättämisestä antibioottihoitoon.
Epämiellyttävä emättimen haju on yleistä useissa sukupuolitaudeissa, erityisesti se voi johtua Gardnerellasta, mutta myös trikomoniasista, Candidasta, gonorrheasta ja lantion tulehduksellisesta sairaudesta. Kun emättimen pahaa hajua aiheuttaa veneraalinen sairaus, kuten gardnerella, se monistetaan kosketuksella siittiöön ja emäksisten saippuoiden kanssa. Haju voi olla erityisen voimakas jopa kuukautisten aikana.
Muut pahan emättimen hajujen syyt ovat huono henkilökohtainen hygienia ja paljon harvemmin kohdunkaulan tai emättimen syöpä, suorakulmaisen fistulan (peräsuolen ja emättimen epänormaali aukko), vakavien sukuelinten herpes, sifilisin tai unohdetusta sisäisestä padista.
Kun emättimen haju muuttuu erityisen pistäväksi ja epämiellyttäväksi, on hyvä lähettää se lääkärille tai gynekologille mahdollisimman pian. Sillä välin on välttämätöntä välttää "do-it-yourself" deodorantteja ja emättimen huuhteluita, jotka diagnoosin estämisen lisäksi voivat pahentaa infektiota.