Eläimissä lintuinfluenssan oireet vaihtelevat sekä infektion aiheuttaman viruksen että kyseessä olevan lajin suhteen. Erityisesti lintuilla tartunnalla on hyvänlaatuinen kurssi, jos se johtuu kaikkien H-alatyyppien ( LPAI - matala patogeeninen lintuinfluenssa ) kuuluvista alhaisista patogeenisista viruksista . LPAI-viruksen aiheuttama tauti on lokalisoitu ja sille on tunnusomaista hengitysteiden ja suolistosairauksien oireet, jotka usein liittyvät yleisiin huonovointisuus-, repeämis- ja lisääntymispoikkeavuuksiin viljelyeläimissä (esim. Munanvaihdokset ja munasolujen väheneminen).
Sitä vastoin jotkut alatyyppeihin H5 ja H7 kuuluvat viruskannat voivat aiheuttaa korkean patogeenisen lintuinfluenssan ( HPAI - korkea patogeeninen lintuinfluenssa ), joka on aina systeeminen ja vakava sairaus, joka liittyy eräiden luonnonvaraisten ja kotieläinlajien kuolleisuuteen. Ilmeisimpiä oireita ovat hermosto, jossa on aistinvaraisen, taaksepäin suunnatun pään pyörimisen ja siipien halvaantumisen väheneminen.
