Tavalliset aminohapot ja proteiinisynteesi
Elävien organismien proteiinirakenteissa esiintyviä aminohappoja kutsutaan tavallisiksi aminohappoiksi tai proteiinituotteiksi. Vaikka luonnossa tunnetaan yli 500 aminohappotyyppiä, on vain kaksikymmentä, joita kutsumme tavallisiksi. Näiden ohella on joitakin harvinaisempia, nimittäin satunnaisia, jotka yleensä johtuvat tavallisten aineiden metaboliasta niiden sisällyttämisen jälkeen proteiiniketjuun. Kollageenissa, esimerkiksi lysiini ja proliini, kaksi tavallista aminohappoa, löytyvät hydroksyloituneesta muodosta (hydroksiproliinista ja hydroksylisiinistä).
Useimmat muut tavanomaiset aminohapot kuuluvat pääasiassa proteiinilajin entsyymien ja hormonien tai pikemminkin peptidin muodostumiseen (muistakaa, että tällaisen huomioon ottamiseksi proteiinin täytyy koostua yli 100 aminohaposta, kun taas muodostaa oligo ja yksi polypeptidi on riittävä 2 - 9 ja 10 - 100).
20 tavallisen aminohapon joukosta muistetaan
Alaniini, arginiini, asparagiini, asparagiinihappo, kysteiini, glysiini, glutamiinihappo, glutamiini, histidiini, isoleusiini, leusiini, lysiini, metioniini, fenyylialaniini, proliini, seriini, treoniini, tryptofaani, tyrosiini, valiini
Esimerkkejä ei-tavallisista aminohapoista ovat:
karnitiini (osallistuu pitkäketjuisten rasvahappojen kuljetukseen mitokondrioiden sisällä, jossa niitä käytetään energian tuottamiseen);
ornitiini, sitrulliini ja homokysteiini (osallistuvat aminohappojen metaboliaan - urean sykli);
hydroksiproliini ja hydroksyylisiini (osa kollageenin ja joidenkin proteiinien koostumusta);
sarkosiini (tai metyyliglysiini).
Joillakin aminohapoilla voi olla myös kaupallista tai farmakologista merkitystä.
- Natriumglutamaattia käytetään elintarviketeollisuudessa maun tehostajana (ks. Varastokuutio).
- L-dihydroksifenyylialaniini (L-DOPA) on lääke, jota käytetään Parkinsonin taudin hoitoon.
- 5-hydroksitryptofaania (5-HTP) on käytetty fenyyliketonuriaan liittyvien neurologisten oireiden hoitoon (perinnöllinen metabolinen tauti, joka estää fenyylialaniinin, välttämättömän aminohapon käytön johtuen erityisistä entsyymipuutoksista; fenyylialaniinin kertyminen) kudoksissa se aiheuttaa vakavaa vahinkoa iholle ja neurologialle).
Kasvit ja bakteerit kykenevät tuottamaan tiettyjä aminohappoja, jotka löytyvät peptidiantibiooteista, kuten nisiinistä ja alameticiinista.
Oleelliset aminohapot
Jotkut 20 tavallisesta aminohaposta kutsutaan välttämättömiksi, koska elimistö ei voi syntetisoida niitä muista yhdisteistä, vaan ne on otettava ruoan kanssa.
Ihmisille nämä ovat fenyylialaniini, leusiini, isusiini, lysiini, metioniini, treoniini, tryptofaani, valiini ja lapsilla histidiini ja arginiini.
Tavalliset aminohapot, kemialliset ominaisuudet
Radikaalin R (atomien ryhmä, joka ei ole kovin pitkä ketju) kemiallisten ominaisuuksien perusteella aminohapot voidaan jakaa eri luokkiin.
Aminohapot apolaarilla R (eivät kykene muodostamaan vetysidoksia):
alifaattisella ketjulla: alaniini, leusiini, isoleusiini, valiini, proliini
aromaattisella ketjulla: fenyylialaniini, tryptofaani
ketjulla, joka sisältää rikkiatomia: metioniini
Aminohapot polaarisella R: llä:
OH-ryhmällä: seriini, treoniini, tyrosiini
SH-ryhmällä: kysteiini
CO-NH2- ryhmällä : asparagiini, glutamiini
H: glysiinillä (ainoa ei-kiraalinen aminohappo)
Aminohapot, joissa on perus-R:
lysiini, arginiini, histidiini
Aminohapot R-hapolla:
glutamiinihappo, asparagiinihappo