Ovomukoidi on voimakkaasti glykosyloitu proteiini (sisältää noin 25% hiilihydraatteja), joka koostuu 186 aminohaposta ja jonka kokonaispaino on 28 000 daltonia. Tyypillinen kananmunanvalkuaineelle muodostaa yksitoista prosenttia sen proteiinifraktiosta; näin ollen keskikokoinen muna sisältää noin 420 mg.
Ovomukoidimolekyyli koostuu kolmesta domeenista, joista kukin - antitripsiiniaktiivisuudella - sisältää kolme disulfidisiltaa ja kaksi tyrosiinitähteitä.
Ovomukoidi tunnetaan kahdesta tärkeästä ominaisuudesta:
1) antitrpsiinin aktiivisuus;
2) allergeeniset ominaisuudet alttiilla yksilöillä.
Mahalaukun pepsiini estää osittain munasolujen anti-proteolyyttistä aktiivisuutta, mutta on edelleen tärkeää kuluttaa hyvin keitettyjä munanvalkuaisia lisäämään sulavuutta, inaktivoimaan avidiinin ja vähentämään riskiä sairastua elintarvikkeiden sairauksiin, kuten salmonellaan.
2) Ovomukoidin allergeeniset ominaisuudet liittyvät E-luokan immunoglobuliinien (IgE-välitteiset allergiset reaktiot) vuorovaikutukseen molekyylin spesifisten rakenneosien kanssa (epitoopit) ja ovat suurelta osin vastuussa allergisista ilmiöistä valkoista vastaan muna.