2–21 vuorokautta infektion jälkeen ensimmäiset ebolan oireet ovat kuume, voimakas heikkous, nivel- ja lihaskipu, päänsärky ja kurkunpään tulehdus, jota seuraa oksentelu, ripuli ja vatsakipu. Viidennestä seitsemäntenä päivänä syntyy tunnusomainen ihottuma, jossa on täplät ja pienet kuplat.
Kun tauti etenee, voi esiintyä maksan tai munuaisten vajaatoimintaa, hyytymisongelmia ja verenvuotoa ruoansulatuskanavan limakalvoista ja sukuelimistä. Potilaalla on yleensä 6–16 päivää aikaa taistella ja tappaa virus, muuten vakava verenvuoto ja kardiovaskulaarinen romahtaminen voivat johtaa kuolemaan. Kuolleisuus vaihtelee Ebola-viruskannan ja hoidon mukaan.
