Iridologia syntyi Unkarissa 1800-luvun lopulla, mutta jo hyvin muinaisina aikoina silmän havaintoa käytettiin diagnostisessa mielessä.
Esimerkiksi perinteisessä kiinalaisessa lääketieteessä iiriksen ja skleraalien eri alueiden tutkimukset vastasivat ihmisen perustekijöitä akupunktion periaatteisiin perustuen.
Moderni iridologia syntyi unkarilaisen homeopaattisen lääkärin Ignazio Von Peczelyn kanssa, jonka tutkimus on peräisin henkilökohtaisista havainnoista, joista osa on peräisin lapsuudestaan.
Anekdootti kertoo, että Von Peczely otti yksitoista-vuotiaana takapihalla pöllön, joka pyrkiessään pakenemaan rikkoi käpälän. Nuori unkari huomasi värikalvon muodostumisen iiriksessä kohdassa, joka vastaa iiriksen topografisen järjestelmän jalkaa.
Tämä merkki iski Von Peczelyä, joka jonkin aikaa huomasi samanlaisen ilmiön ihmisen iiriksessä ja, myös lääketieteen opintojensa ansiosta, julkaistiin vuonna 1880 tekstillä " Johdatus diagnoosin tutkimukseen silmien läpi " ja vuonna 1886 ensimmäinen iiriksen topografia.
