Japanilainen enkefaliitti on laajalti levinnyt lähes koko Aasiassa ja joillakin Oseanian alueilla. Useimmille matkailijoille riski tartunnan saamisesta on yleensä rajoitettu, mutta kohde, oleskelun kesto ja oleskelun aikana toteutetut toimet on otettava huomioon.
Riskialueet ovat ennen kaikkea maaseutu- ja maatalousalueita, erityisesti niitä, jotka on tarkoitettu riisin viljelyyn, jossa tauti on endeeminen. Kaupunkikeskusten lähellä tai niiden läheisyydessä olevat tapaukset eivät kuitenkaan ole harvinaisia, jos hyttysten kehitykselle suotuisat olosuhteet ovat olemassa.
Kaakkois-Aasiassa sairastumisriski tartunnan saaneiden hyttysten kautta on läsnä koko vuoden, ja monsuunisateiden vastaavuus korostuu kuivakauden alkuun asti; Kiinan, Japanin ja Korean niemimaan lauhkealueilla siirto on kuitenkin suurempi toukokuusta syyskuuhun (kuljettajien suurempi aktiivisuus). Kun matkustat endeemisiin alueisiin, rokotus voidaan suositella.
