Mojito on tyypillinen Havannan juoma, vaikka tarkka juoman syntymispaikka on vielä keskustelun kohteena.
Tulosten mukaan näyttää siltä, että Kuubassa 16. vuosisadalla syntyi El Draque -juoma, kun Francis Drake tuli. Vuonna 1586 Cartagena de Indiasin uudisasukkaiden hyökkäyksen jälkeen he menivät Havannaan. Valitettavasti useat sairaudet alkoivat pettää miehistöä (varsinkin raivoissaan), niin että pieni joukko merimiehiä laskeutui Kuubaan ottamaan hallussaan alkuperäisväestölle tyypillisiä suosittuja lääkkeitä. He palasivat "aguardiente de canan" (eräänlainen rommi), kalkin, mintun ja sokeriruo'on mehun kanssa. Kalkki olisi sinänsä riittänyt parantamaan huijausta, mutta mitä kukaan ei voinut kuvitella, on se, että (kuten minttu- ja sokeriruokamehun) ainesosat on suunniteltu korjaamaan "ihmeellisen alkoholijuoman epämiellyttävä maku" ": El Draque
Kuuban väestö (muutama vuosikymmen myöhemmin) kastettiin todelliseen Mojitoon (luultavasti), joka perustuu tyypilliseen kalkkipohjaiseen mausteeseen "Mojo". Toinen teoria on, että se tulee "mojaditosta", joka tarkoittaa "vähän märkää" tai yksinkertaisesti "mojado" - tai "märkä" -muotoa.
